Por defecto JosSecurity tiene un Jossito llamado conect_mysql y conect_mysqli, con este jossito podrás crear una conexión y almacenarlo en una variable como se muestra a continuación.
<?php
// conexión mysqli clásica.
$conexion = conect_mysqli();
// conexión mysql PDO.
$pdo = conect_mysql();
?>
Funciones
El sistema de jossitos necesita obtener la conexión dentro del archivo env y después hace el trabajo JosSecurity con sus comandos correspondientes.